2.1. Магістерська підготовка відкривається на факультеті та кафедрах, які, згідно з існуючим положенням, мають право на підготовку магістрів.

2.2. На магістерську підготовку можуть претендувати особи, що мають:

•  ступінь бакалавра відповідного професійного спрямування (з терміном навчання 2 роки);
•  кваліфікацію дипломованого спеціаліста (з терміном навчання 1 рік);

2.3. Організацією прийому та зарахуванням до магістратури займається приймальна комісія університету. Правила прийому, дата подачі документів та зарахування до магістратури регламентують "Правила прийому до Вінницького державного аграрного університету на поточний рік". При цьому вони щорічно уточнюються і коректуються.

2.4. Державна атестація по закінченню магістратури передбачає складання випускних іспитів з відповідної дисципліни та захист магістерської роботи на засіданні Державної екзаменаційної комісії з присвоєнням освітньо-кваліфікаційного рівня "магістр".